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  • Centre National de Génotypage
    goals of the meeting Chairman Prof Mark Lathrop 09 00 FP6 Genomics and biotechnology for health the main action lines Dr Manuel Hallen European Commission DG Research 09 15 FP6 From expressions of interest to indicative priority topics in fundamental genomics Dr Bernard Mulligan European Commission DG Research 2 Scientific context 09 30 Genomics and health Prof Annemarie Poustka DKFZ Germany 10 00 Genetic epidemiology an EU integrated programme Prof Leena Peltonen University of Helsinki Finland 10 30 Coffee 11 00 Clinical approaches and genomic tools for high fidelity phenotyping in human populations Prof John Bell University of Oxford UK 11 30 Specificities of genetic research on rare diseases Dr Pascale Borensztein Faculté Bichat France Prof Mark Lathrop CNG France 12 00 Population based genetic studies The example of Iceland Dr Struan Grant DeCode Genetics Iceland 12 30 Estonian genome project Dr Andres Metspalu Estonia 13 00 Lunch 3 Scoping the issues Chairman Prof Eero Vuorio 14 00 Review of tissue banks genetic registries and cohort studies 10 minutes for each country Austria Belgium Czech Republic Cyprus Estonia Finland France Germany Hungary Latvia Ireland Israel Italy The Netherlands Norway Portugal Sweden and UK 16 00 Coffee 16 30 Review continued 4 Lessons from other populations 18 00 Human genetic studies in India Prof Jai Rup Singh Centre for Genetic Disorders India 18 45 Genetic studies in Australia the kConFab model Dr Rodney John Scott John Hunter Hospital Australia 19 15 End of the session Saturday October 19 th 2002 5 Ethical and legal context Chairmen Prof Mark Lathrop and Prof Eero Vuorio 09 00 Ethical aspects in different kinds of biobanks used for genomics in Europe Dr Anne Cambon Thomsen Faculty of Medicine Toulouse France 09 30 Standpoint from pharmaceutical industry Dr Klaus Lindpaintner Roche Genetics Basel 6 Preparing for

    Original URL path: http://www.cng.fr/en/news/cogene_program_inaugural.html (2016-01-29)
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  • Centre National de Génotypage
    SNP genotyping by MALDI mass spectrometry Karsten Schmidt Sequenom Anthony Brookes Stockholm Sweden DASH Dynamical Allele Specific Hybridization for SNP genotyping Anders Alderborn Pyrosequencing Stephen Little MasssCode Qiagen Scott White Los Alamos USA Coded bead approaches to SNP genotyping Sue Ann Molero Applied Biosystems David Gelfand Biochemical Properties of Thermophilic DNA Polymerases Applications for PCR and DNA Sequencing Friday 3 May 2002 Methodology for analyzing genome variation Mark Lathrop Evry

    Original URL path: http://www.cng.fr/en/news/atelier136_speakers.html (2016-01-29)
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  • CNG - Careers
    multidisciplinary team low medium and high throughput genotyping and sequencing platforms bioinformatics epigenetics functional biology The successful applicant will be at the forefront of genetic research by developing supporting and coordinating the statistical support of the CNG and its collaborators Moreover he will develop independent methodological projects relying on the numerous genetic and genomic datasets that we generate on a wide range of phenotypes cancers neuro psychiatric diseases cardio metabolic diseases infectious diseases population genetics studies The CNG provides substantial resources to enable leading statistical research including access to a world class super computer TGCC at the CEA http www hpc cea fr en complexe tgcc htm and close interactions with the high quality French statistical genetics community The roles of this researcher will include the management of large scale genetic and genomic datasets the design and implementation of analytical pipelines for large scale datasets the support of internal teams and external collaborators at all stages of their studies design and power assessment quality control of platforms output analysis of datasets publication the development of personal methodological projects in statistical genetics integrated within the larger scope of the CNG Skills Ph D in statistical genetics biostatistics applied mathematics statistics computational

    Original URL path: http://www.cng.fr/en/news/res_statgen.html (2016-01-29)
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  • CNG - News
    Expérience originale dans laquelle nous allons extraire un agrégat visible à l œil nu de filaments de votre propre ADN provenant de cellules buccales 1er étage 4 Visite plateforme Séquençage 1er étage salle du TAP 5 Rencontre avec notre robot dynamique 6 A vos pipettes 1er étage salle Saphir 7 Mastermind génétique 8 Elevage de minions 9 Jeu des 7 mutations 10 Jeu des spots retrouvez la séquence RDC salle

    Original URL path: http://www.cng.fr/en/news/fds2015_programme.html (2016-01-29)
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  • CNG - News
    A L INSTITUT DE GENOMIQUE CENTRE NATIONAL DE GENOTYPAGE EVRY Le Centre National de Génotypage CNG a pour mission l identification des gènes impliqués dans des pathologies humaines en utilisant des technologies de pointe de génotypage et de séquençage Il participe aussi à la compréhension des interactions entre gènes et environnement dans les cancers et les maladies neuro dégénératives pour avancer vers une médecine personnalisée Les outils et le savoir faire développés au CNG sont mis à la disposition des équipes scientifiques pour collaborer sur des programmes français et internationaux Un circuit découverte est proposé au public samedi 12 et dimanche 13 octobre de 10h00 à 17h00 sans interruption Vous découvrirez les enjeux et les applications du séquençage du génome humain Lors de la visite guidée de nos laboratoires durée prévue 1 heure vous allez participer à différents ateliers Dans un langage accessible à tous vous découvrirez au programme plusieurs ateliers extraction d ADN mastermind génétique jeu des 7 mutations élevage des dragons ainsi qu une enquête scientifique avec nos experts qui vous dévoileront comment identifier un coupable grâce à sa carte d identité génétique Nos chercheurs initieront le public aux bases de la génétique du séquençage et de la

    Original URL path: http://www.cng.fr/en/news/fds2013.html (2016-01-29)
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  • CNG - News
    tu TAP TAP TAP Nous vous présenterons un de nos robots de pipetage qui permet de remplir de façon automatique des plaques multipuits Vous verrez avec quelle rapidité et surtout quelle précision ce robot est capable de remplir des plaques de 384 puits Atelier 2 A vos pipettes Vous serez ensuite amenés à remplir vous même des plaques de 96 ou 384 puits à l aide de pipettes manuelles comme celles que nos chercheurs utilisent au quotidien Vous verrez que le remplissage des plaques requiert beaucoup de précision et d attention Atelier 3 au coeur de la génétique avec Le Mastermind génétique Cet atelier permet de comprendre pourquoi un gène peut être considéré comme un mot dont le sens est défini par les lettres qui le composent Chaque participant aura pour mission de découvrir la combinaison cachée d un gène en manipulant les bases de l ADN comme les billes de couleurs du célèbre jeu Mastermind Attention une mauvaise combinaison changera complètement le sens du mot et donc du gène Élevage de dragons Vous voilà devenu éleveur de dragon M et Mme DRAGON vont bientôt donner naissance à leur premier petit Comment découvrir à quoi il ressemblera Grandes ou petites ailes Cracheur de feu Griffes acérées Cet atelier vous apportera les réponses à toutes ces questions Jeu des 7 mutations Vous allez comprendre comment les modifications mutations dans la séquence de l ADN peuvent avoir des graves conséquences au niveau de l organisme tout entier Nous vous présenterons une des stratégies utilisées pour rechercher des mutations dans notre génome Vous partirez vous même à la recherche des mutations à l aide d une carte de génotypage Serez vous capable de les trouver Atelier 4 Une enquête scientifique de l inspecteur Crick et du docteur Watson uniquement samedi 12 octobre Léo

    Original URL path: http://www.cng.fr/en/news/fds2013_programme.html (2016-01-29)
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  • High Throughput Platform
    83 E mail bihoreau cng fr The High Throughput Platform team is involved in the integration of novel sequencing and genotyping methods into the research activities of the CNG The CNG is developing a strong activity of high throughput sequencing by expanding the platform of Illumina automates that can be used for studying the genetics of multifactorial diseases and rare diseases The LHD laboratory as recently acquired the X Five

    Original URL path: http://www.cng.fr/en/organisation/laboratories/haut_debit/index.html (2016-01-29)
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  • High Throughput Platform - Genotyping
    one of the first sites to set up SNP genotyping production on a completely automated high throughput Illumina genotyping platform The Beadlab consists in physically separated one PRE and two POST PCR laboratories with separated ventilation and air conditioning systems Currently it is equipped with 6 Tecan liquid handling robots and 3 Illumina scanners iScans PRE PCR POST PCR Beadchips reading on scanners Four technicians work in these two laboratories under the supervision of a line manager The operation of the genotyping Infinium Assay procedures are seamlessly tracked by a Laboratory Information Management System LIMS from DNA plating liquid handling to scanning Data are handed off to quality control to assure generation of highly accurate genotypes Turn around time is 3 days including overnight hybridisation Multiple processes of 96 DNA samples are simultaneously run every day The current throughput of 10 000 DNA samples per week corresponds to data production of more than 2 000 000 000 genotypes per week Infinium Assay Chip Prep The whole genome genotyping technology Infinium is based on the beadchip technology At CNG we run the high density chips 250K à 5M markers Human Core OmniExpress Omni2 5 and Omni 5 0 Pre selected SNPs

    Original URL path: http://www.cng.fr/en/organisation/laboratories/haut_debit/genotyping/index.html (2016-01-29)
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