archive-fr.com » FR » C » CNG.FR

Total: 170

Choose link from "Titles, links and description words view":

Or switch to "Titles and links view".
  • CNG - Carrière
    team low medium and high throughput genotyping and sequencing platforms bioinformatics epigenetics functional biology The successful applicant will be at the forefront of genetic research by developing supporting and coordinating the statistical support of the CNG and its collaborators Moreover he will develop independent methodological projects relying on the numerous genetic and genomic datasets that we generate on a wide range of phenotypes cancers neuro psychiatric diseases cardio metabolic diseases infectious diseases population genetics studies The CNG provides substantial resources to enable leading statistical research including access to a world class super computer TGCC at the CEA http www hpc cea fr en complexe tgcc htm and close interactions with the high quality French statistical genetics community The roles of this researcher will include the management of large scale genetic and genomic datasets the design and implementation of analytical pipelines for large scale datasets the support of internal teams and external collaborators at all stages of their studies design and power assessment quality control of platforms output analysis of datasets publication the development of personal methodological projects in statistical genetics integrated within the larger scope of the CNG Skills Ph D in statistical genetics biostatistics applied mathematics statistics computational biology

    Original URL path: http://www.cng.fr/fr/news/res_statgen.html (2016-01-29)
    Open archived version from archive


  • CNG - Actualités
    Expérience originale dans laquelle nous allons extraire un agrégat visible à l œil nu de filaments de votre propre ADN provenant de cellules buccales 1er étage 4 Visite plateforme Séquençage 1er étage salle du TAP 5 Rencontre avec notre robot dynamique 6 A vos pipettes 1er étage salle Saphir 7 Mastermind génétique 8 Elevage de minions 9 Jeu des 7 mutations 10 Jeu des spots retrouvez la séquence RDC salle

    Original URL path: http://www.cng.fr/fr/news/fds2015_programme.html (2016-01-29)
    Open archived version from archive

  • CNG - Communiqué de presse
    Jean Dausset CEPH sont des opérateurs aux côtés des équipes de recherche de l Institut Thématique Multi organismes Cancer fédérées par les cancéropôles Les programmes de recherche sur le mélanome et le gliome ont aussi été soutenus en France par la Ligue Nationale contre le Cancer LNCC et le Programme Hospitalier de Recherche Clinique Les mélanomes Le mélanome est le cancer de la peau qui engage le plus le pronostic vital et son incidence dans les populations Caucasiennes n a cessé d augmenter au cours de ces dernières décennies Il existe une variabilité importante de l incidence du mélanome selon les pays qui reflète une interaction entre la couleur de la peau et l exposition au soleil Les taux d incidence en France 9 5 cas pour 100 000 chez les femmes et 7 6 cas pour 100 000 chez les hommes sont intermédiaires à ceux observés en Europe où ils sont plus élevés dans les populations scandinaves à peau claire que dans les populations méditerranéennes à peau plus foncée Le mélanome cutané se situe au 18 ème rang de décès par cancer Le mélanome résulte de multiples facteurs génétiques et environnementaux Le facteur de risque environnemental majeur est l exposition au soleil à plus forte raison lorsqu elle est intense intermittente et a lieu durant dans l enfance Les caractéristiques pigmentaires des sujets cheveux roux ou blonds peau claire yeux clairs et la présence de nombreux grains de beauté naevus augmentent le risque de mélanome et comme le mélanome sont influencés par des facteurs génétiques Il conviendra de préciser dans des études ultérieures si les variants génétiques identifiés influencent l apparition du mélanome principalement via les caractéristiques pigmentaires et les grains de beauté ou si certains de ces variants agissent directement sur le risque de mélanome Les gliomes Les gliomes représentent environ 80 des tumeurs malignes primitives du cerveau Ils affectent près de 3 000 sujets par an en France La plupart des gliomes engagent le pronostic vital et sont la troisième cause de mortalité chez l adulte jeune Les gliomes comme les autres cancers résultent vraisemblablement de nombreux facteurs génétiques et environnementaux Mis à part le petit nombre de cas de gliomes radio induits ou les formes génétiques rares bien caractérisées la cause de ces tumeurs est encore mal connue L UMR 946 INSERM Université Paris Diderot Paris 7 Variabilité Génétique et Maladies Humaines localisée au sein de la Fondation Jean Dausset CEPH à l Hôpital Saint Louis à Paris est engagée dans un programme de recherche qui vise à identifier les gènes et les interactions gènes environnement impliqués dans le déterminisme des maladies humaines Ce programme associe des études de génétique épidémiologique de différentes pathologies cancers asthme maladies neuro psychiatriques des recherches en méthodologie Statistique pour optimiser la détection des gènes et modéliser leurs effets et leurs relations avec les facteurs de l environnement et des approches de génétique des populations pour mieux comprendre l origine et la dissémination des variations génétiques au sein des populations humaines

    Original URL path: http://www.cng.fr/fr/news/pr_jul2009_fr.html (2016-01-29)
    Open archived version from archive

  • Laboratoire Haut Débit
    83 83 Courriel bihoreau cng fr L équipe du Laboratoire Haut Débit est impliquée dans l intégration de nouvelles méthodes de séquençage et de génotypage pour l activité de recherche du CNG Le CNG développe une forte activité de séquençage à haut débit avec la mise en place d une plateforme d automates Illumina adaptée à plusieurs stratégies d étude des maladies multifactorielles et des maladies rares Le LHD s

    Original URL path: http://www.cng.fr/fr/organisation/laboratories/haut_debit/index.html (2016-01-29)
    Open archived version from archive

  • Laboratoire Haut Débit - Génotypage
    ventilation et de climatisation indépendants Il est actuellement équipé de 6 robots de pipetage Tecan et de 3 iScans PRE PCR POST PCR Lecture des lames sur scanner Quatre techniciens travaillent dans ces deux laboratoires sous le contrôle d un responsable de plateforme Les étapes du protocole Infinium Assay sont totalement tracées par un LIMS Laboratory Information Management System de la plaque d ADN en passant par les étapes robotiques et jusqu aux lectures sur les scanners Les données produites sont vérifiées par l équipe de contrôle qualité ce qui participe à la génération de génotypes de très haute qualité Le temps de traitement des lames est de 3 jours incluant l étape d hybridation qui se déroule sur la nuit Plusieurs lots de 96 échantillons d ADN sont traités simultanément chaque jour Le débit actuel est de 10 000 échantillons d ADN par semaine ce qui correspond à la production de plus de 2 000 000 000 de génotypes par semaine Infinium Assay Chip Prep La technologie d analyse globale du génome Infinium Assay est basée sur l hybridation de l ADN à des billes magnétiques déposées sur une lame et sur l élongation d une seule base spécifique

    Original URL path: http://www.cng.fr/fr/organisation/laboratories/haut_debit/genotyping/index.html (2016-01-29)
    Open archived version from archive

  • Laboratoire Haut Débit - Séquençage
    sont axés sur le séquençage du génome entier le re séquençage ciblé le séquençage des facteurs régulation des gènes et épigénétiques RNASeq RNASeq directionnel ChIPSeq MeDIP BiSeq petit ARN La plateforme participe à la recherche des facteurs génétiques et épigénétiques de maladies complexes cancers et maladies rares Elle est aussi largement ouverte à la communauté scientifique et partenaire du réseau national France Génomique Grâce au développement en interne d un LIMS Laboratory Information Management System le suivi d un nombre élevé d échantillons est garanti Le logiciel permet l automatisation du procédé expérimental et le contrôle qualité de la préparation des échantillons jusqu aux analyses des séquences générées Suivi réactif avec le LIMS Laboratoire PRE PCR Laboratoire POST PCR La plate forme de séquençage est séparée en zones dédiées PRE et POST PCR Pour la plupart des applications la préparation des échantillons est automatisée 2 robots Sciclone NGSx et 1 Bravo Workstation Dans le laboratoire post PCR les échantillons sont hybridés sur la Flowcell support en verre pour la réaction de séquençage Stations cBot de clusterisation Etape du clusterisation d une FC 2500 La station cBot permet la préparation d une Flowcell en quatre heures Grace à l automatisation elle

    Original URL path: http://www.cng.fr/fr/organisation/laboratories/haut_debit/sequencing/index.html (2016-01-29)
    Open archived version from archive

  • CNG - Laboratoire Haut Débit
    Thérèse Bihoreau a obtenu un doctorat en Endocrinologie et Développement à l Université Pierre et Marie Curie Paris VI Après avoir effectué un post doc à l université Mc Gill de Montréal Canada puis à L INSERM U299 pour développer un substitut du sang elle a travaillé plusieurs années au Wellcome Trust Centre for Human Genetics à Oxford Royaume Uni Chargée du développement de ressources génétiques du génome du rat

    Original URL path: http://www.cng.fr/fr/organisation/laboratories/haut_debit/bihoreau_cv_fr.html (2016-01-29)
    Open archived version from archive

  • CNG - Programmes
    Organisation FONDATION JEAN DAUSSET CENTRE D ETUDE DU POLYMORPHISME HUMAIN FONDATION RUE JULIETTE DODU PARIS 10 FRANCE Web site https www cng fr cagekid Project description The International Cancer Genome Consortium ICGC has the goal of obtaining a comprehensive description of genomic transcriptomic and epigenomic changes in 50 different tumour types and or subtypes with the aim of elucidating the genomic changes present in the many forms of cancers that contribute to the burden of disease throughout the world We present a proposal for a European contribution to this effort through application of state of the art approaches to the genomics of the most common form of renal cell cancer RCC RCC is of particular importance within Europe where the highest global incidence rates are observed Disease incidence has increased over the last two decades and it is now the 8th most common cancer in the EU CAGEKID brings clinical and epidemiological resources that are unique worldwide together with the necessary genetics and genomics expertise required for this effort In the first phase of the study we will provide a full genomic characterisation of 100 matched pairs of DNA extracted from the tumour and constitutional samples DNA will be completely sequenced and the data brought together with those from whole genome transcript and methylation analyses Follow up studies of potential targets will be made in further samples The results acquired will be relied to targeted protein analyses The primary data will be made available to the scientific community and the programme will contribute to establishing norms for the manipulation and storage of biological samples CAGEKID will provide the first systematic analysis of this tumour site providing new insights into disease aetiology with application for diagnosis and treatment It addresses a major need to identify new biological markers for renal cell

    Original URL path: http://www.cng.fr/fr/projects/fp7_cagekid.html (2016-01-29)
    Open archived version from archive



  •